一、招標代理機構(gòu)作為專門從事招標投標工作的中介組織，必須具有與其所從事的招標代理業(yè)務(wù)相適應(yīng)的專業(yè)代理資格，并須經(jīng)有關(guān)行政主管部門的認定。在現(xiàn)行體制下，招標代理機構(gòu)所從事代理業(yè)務(wù)的領(lǐng)域不同，其資格認定機關(guān)也有所不同。根據(jù)本條第1款的規(guī)定，招標代理機構(gòu)的資格認定分為兩個層次：

　　1．從事工程建設(shè)項目招標代理業(yè)務(wù)的招標代理機構(gòu)的代理資格按照管理權(quán)限劃分，分別由國務(wù)院建設(shè)行政主管部門和省級人民政府建設(shè)行政主管部門認定。認定的辦法應(yīng)由國務(wù)院建設(shè)行政主管部門會同國務(wù)院有關(guān)部門制定，建設(shè)行政主管部門不應(yīng)單獨制定具體辦法。

　　2．從事其他招標代理業(yè)務(wù)包括貨物采購及服務(wù)等的招標代理業(yè)務(wù)，按照國家規(guī)定需要進行資格認定的，其代理資格的認定由國務(wù)院規(guī)定的主管部門認定。這主要是考慮其他招標代理業(yè)務(wù)范圍較廣，情況比較復(fù)雜，不宜統(tǒng)一在法律中規(guī)定，因此授權(quán)國務(wù)院根據(jù)實際情況作出規(guī)定。

　　二、招標代理機構(gòu)一經(jīng)法定程序設(shè)立，便成為獨立從事招標代理業(yè)務(wù)及相關(guān)服務(wù)的中介組織，其依法開展業(yè)務(wù)活動不受任何行政單位的干涉。為了保證招標代理工作公正、客觀、有效的進行，也為了依法糾正目前實際中存在的某些招標代理機構(gòu)依附于行政機關(guān)，借用行政權(quán)力實行強制代理，損害招標人利益，有關(guān)行政機關(guān)也借此謀取不正當利益的現(xiàn)象，本條第2款明確規(guī)定：招標代理機構(gòu)與行政機關(guān)和其他國家機關(guān)不得存在隸屬關(guān)系或者其他利益關(guān)系。這一規(guī)定中“其他國家機關(guān)”，包括各級國家權(quán)力機關(guān)和司法機關(guān)。這里講的“隸屬關(guān)系”，是指招標代理機構(gòu)與行政機關(guān)或其他國家機關(guān)的直屬上下級關(guān)系；“其他利益關(guān)系”，主要是指經(jīng)濟上的利益關(guān)系，如有的招標代理機構(gòu)將其業(yè)務(wù)收入的一部分上交給其依附的行政機關(guān)，作為其小金庫收入等。根據(jù)本法和有關(guān)法律、法規(guī)的規(guī)定，國務(wù)院和有關(guān)地方行政主管部門對招標代理機構(gòu)有按照分工對其專業(yè)代理資格進行認定、營業(yè)登記和對其業(yè)務(wù)活動進行監(jiān)督的權(quán)利，對招標代理機構(gòu)沒有領(lǐng)導(dǎo)權(quán)。招標代理機構(gòu)應(yīng)當完全按照市場規(guī)律運作，財務(wù)獨立、人事獨立、自主經(jīng)營、自負盈虧。目前我國現(xiàn)行招標代理機構(gòu)的體制存在嚴重的弊端，現(xiàn)有的招標代理機構(gòu)，有些比較規(guī)范，也有相當部分尚不規(guī)范，如有的是行政機關(guān)的下設(shè)機構(gòu)，有的是事業(yè)單位，有的是企業(yè)但行使行政職能，不少都隸屬于行政主管部門，政企不分，缺乏統(tǒng)一規(guī)范。本法實施后，招標代理業(yè)應(yīng)當通過整頓，逐步理順關(guān)系，與行政主管部門脫鉤，成為真正獨立的社會中介組織